Drevna DNA Otkriva Priču O Konju

2024 Autor: Daisy Haig | [email protected]. Zadnja promjena: 2023-12-17 03:09

PARIZ - Znanstvenici su prošle srijede rekli da su razotkrili DNK konja koji je živio prije nekih 700 000 godina, što je rekordni podvig u mladom polju paleo-genomike.

Drevno otkriće ukazuje na to da su svi konji danas, kao i magarci i zebre, imali zajedničkog pretka koji je živio prije nekih četiri milijuna godina, dvostruko ranije nego što se mislilo.

Proboj također budi nadu da bi mnogi fosili koji se smatraju beskorisnima za uzorkovanje DNK u stvari mogli biti pretrpani genetskim blagom, rekli su istraživači.

Izvještavajući u časopisu Nature, tim je rekao da je priča započela prije 10 godina otkrićem dijela fosilizirane konjske kosti u vječnom ledu na mjestu zvanom Thistle Creek, na kanadskom teritoriju Yukon.

"To je komad metapodijalne kosti" s noge, rekao je Ludovic Orlando, francuski istraživač iz Centra za geogenetiku u danskom Prirodoslovnom muzeju.

"To je ulomak dug oko 15 centimetara (šest inča) i širok osam centimetara (3,2 inča)."

Radiodatiranje tla u kojem je pronađena kost ukazuje da je tamošnji organski materijal - razgrađeni listovi i tako dalje - taložen prije oko 735 000 godina.

Uzorak je bio zapanjujuće sačuvan u dubokoj hladnoći - ali vrijeme je sigurno oštetilo njegove stanice i time ograničilo šanse da iz njega istrgne korisnu DNK.

"Bila je to jedinstvena prilika da našu tehnologiju dovedemo do krajnjih granica," rekao je Orlando za AFP.

"Da budem iskren, ni sam nisam mislio da će to biti moguće kad smo se prvi put pozabavili tom idejom."

Te su rane sumnje počele rasti u laboratoriju, kada su istraživači uspjeli odrediti ostatke kolagena - glavnog proteina koji se nalazi u kostima, kao i biološke markere za krvne žile.

Što je sa staničnom DNA?

U tom je trenutku došlo razočaranje. Tehnologija koja je bila dostupna na početku analize prije tri godine nije uspjela uzeti te malene ostatke DNA i pretvoriti ih u razumljiv kôd.

"Uspjeli smo dobiti komad DNA sekvence otprilike jednom u svakih 200 pokušaja", rekao je Orlando.

Ono što je promijenilo stvar bila je generacijska promjena tehnologije sekvenciranja.

Iskorištavajući inovaciju u medicinskim istraživanjima, znanstvenici su pronašli način da razotkriju molekule DNA bez da ih moraju "pojačavati" u stroju za sekvenciranje.

Ovaj pristup značio je da dragocjeni uzorak nije rasipan beskrajnim neuspjesima, a rizik daljnje propadanja rukovanjem i izlaganjem zraku minimiziran je.

Ishod je bio tri do četverostruko poboljšanje stope uspjeha, koje se povisilo na faktor 10 kada su temperatura i način ekstrakcije dodatno prilagođeni.

"Prešli smo s jednog na 200 na otprilike jednog na 20", rekao je Orlando.

"Ono što je proizašlo iz ovoga bili su sitni komadići sekvenci, koje smo potom morali ponovno sastaviti u puni genetski kod", rekao je.

"To je poput popravljanja vaze koja se razbila na tisuću dijelova - samo što ova ima milijarde komada!"

Rezultat je najstariji genom koji je u potpunosti sekvenciran - od životinje koja je živjela između 560 000 i 780 000 godina.

Prethodni je rekord zabilježen nizanjem zagonetnih ljudi poznatih kao Denisova hominin, koji su živjeli prije 70 000 do 80 000 godina.

Slijed konja uspoređivan je s genomom konja koji je živio u kasnom pleistocenu prije 43 000 godina, kao i s petom modernim pasminama konja, konjem Przewalskog (divlja vrsta kopitara koja se razišla od domaćeg konja), i magarac.

"Naše analize sugeriraju da loza Equusa koja je rađala sve suvremene konje, zebre i magarce potječu od četiri do 4,5 milijuna godina prije sadašnjosti, dvostruko više od uobičajeno prihvaćenog vremena", kaže studija.

Također je sugeriralo da su napori na očuvanju konja Przewalskog, križanjem s domaćim pasminama, genetski valjani. Čini se da je bilo malo genetskog upada u divlju varijantu.

Osim ovog neposrednog otkrića, znanstvenici su sigurni da će njihov rad jednog dana rasvijetliti pretpovijesne životinje ili čak i naše vlastite preteče, kroz fosile čija se DNK konvencionalno smatra previše degradiranom za sekvenciranje.

"U vrlo hladnim uvjetima otprilike 10 posto molekula male veličine ima dobre šanse preživjeti i preko milijun godina", rekao je Orlando.

"Otvorili smo vrata za koja smo mislili da su zauvijek zatvorena. Sve ovisi o tehnološkom napretku, ali imamo puno argumenata za vjerovanje da će nas budućnost odvesti do blaga, a ne slijepe ulice."